г.Москва
на сайт ВНИИЗЖ
В марте 2018 года заместитель начальника Тульского отдела карантина растений и качества семян фитосанитарной испытательной лаборатории ФГБУ ЦНМВЛ Углова Е.А. проходила обучение на базе ФГБУ «ВНИИКР» по теме: «Применение метода секвенирования для диагностики карантинных вредных организмов».
Секвенирование нуклеиновых кислот – это расшифрока «букв»- нуклеозидтрифосфатов их нуклеотидной последовательности: дАТФ, дГТФ, дЦТФ, дТТФ и УТФ. Для простоты понимания эти «буквы» обозначают согласно азотистому основанию, входящему в их состав — аденин (А), гуанин (Г), цитозин (Ц), тимин (Т), а также урацил (У) в случае РНК.
Каждое растение, бактерия, насекомое, гриб и т.д., так же, как и человек, имеет особую, уникальную нуклеотидную последовательность.
При морфологической, визуальной идентификации вредных организмов могут возникнуть сложности.Например, у Непарного шелкопрядаLymantriadispar L. карантинным является только Азиатский подвид LymantriadisparasiaticaVnukovskij(Lda). При идентификации по морфологическим признакам можно отличить Lymantriadispar L. – непарный шелкопряд от Lymantriamonacha – монашенка, LymantriamathuraWlk. – розовый непарник, но визуально определить расу неполучится. Для того, чтобы определить, относится непарный шелкопряд к европейско-североамериканскому, азиатскому и японскому подвиду необходимо провести молекулярно-генетический анализ.
В процессе секвенирования ДНК получается последовательность генома, которую впоследствии нужно будет биоинформатически «обработать», т.е. сравнить с уже ранее отсеквенированным (референсным) геномом.
